RNase R——RNase家族的“外貌协会成员”

RNA酶，是一种将RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶。可简单分为外切核糖核酸酶和内切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase，RNase PH，RNase Ⅱ，RNase R，RNase D，RNase T，Oligoribonuclease，Exoribonuclease I，Exoribonuclease Ⅱ 等；内切酶包括RNase A，RNase H，RNase I，RNaseⅢ，RNase L，RNase P，RNase PhyM，RNase T1，RNase T2，RNase U2，RNase V1，RNase V 等。

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在成员众多的RNase家族，就有这么一个“外貌协会”成员，它就是只针对线性RNA的RNase R。在介绍RNase R之前，先允许小达君给大家科普下环状RNA~~

图1. 线性RNA与环状RNA

环状RNA（Circular RNA，circRNA）是区别于线性RNA的一类新型环状非编码RNA，半衰期长，具有物种保守性和组织特异性。其独特的环状结构使其不容易被RNA酶降解，因此在细胞内稳定性很强，在新型生物标记、生物学机制研究等方向具有巨大的潜力和研究价值。

图2. 环状RNA的稳定性

“cicrRNA”这一概念较早出现在1971年，在RNA病毒中被发现，但长期以来，由于其表达丰度很低，所以一直被认为是转录的“噪音”，没有实际作用。

图3. 环状RNA的miRNA海绵作用

直到2012年，Salzman的一篇环状RNA文章为其正名，于是大量的研究者涌入这个领域，不断产出环状RNA的研究成果。目前研究较多的就是位于细胞质中的外显子形成的环状RNA，其含有大量miRNA结合位点，可起到miRNA海绵作用，结合并封闭miRNA的调控作用，从而使其靶基因表达增强。

图4. RNase R分离套索RNA

随着环状RNA的深入研究，环状RNA制备问题就越来越备受关注。Lucigen提供大肠杆菌来源的RNase R，是一种Mg依赖性的3’ →5’核糖核酸外切酶，能消化基本上所有线性RNA，但不消化套索或环状RNA的结构，或者3’突出短于7个核苷酸的双链RNA。即是除了tRNA，5S RNA和内含子套索结构外，大多数细胞RNA都将被RNase R完全消化。如图4，RNase R可从总RNA中分离出内含子前体mRNA剪切产生的套索RNA。以这种方法获得的RNA作为模板来生产标记的cDNA，可作为含有潜在的内含子序列的微阵列的目标，或者用于包含完整的染色体或者基因组的重叠区域平铺阵列。产生的cDNA不代表线性内含子，但其含有的序列是来源于内含子的。

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