重亚硫酸盐转化是研究DNA甲基化的金标方法。该技术基于非甲基化胞嘧啶(C)向尿嘧啶(U)的化学转化,即用重亚硫酸盐处理基因组DNA,非甲基化胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化胞嘧啶不发生这种转化,从而能够在单核苷酸水平上确定DNA甲基化(图1)。转化后的序列可以进行多种分析,包括重亚硫酸盐测序、焦磷酸测序、甲基化特异性PCR、高分辨率熔解曲线分析、基于微阵列的方法和下一代测序。
图1 DNA重亚硫酸盐转化概述
Diagenode根据您希望获得的覆盖度,提供不同的解决方案。
Diagenode DNA甲基化解决方案
优质Bisulfite Kit
●特定区域研究甲基化的方法
●快速的DNA亚硫酸氢盐转化 — 只需1小时完成实验
●无中间步骤
●甲基化分析中更高的DNA转化率
产品名称 |
货号 |
规格 |
Premium Bisulfite kit |
C02030030 |
50 rxns |
Auto Premium Bisulfite kit |
C02030031 |
40 rxns |
优质RRBS Kit (Reduced Representation Bisulfite Sequencing,简化甲基化测序)
●覆盖范围广 – 4 million CpGs
●高通量 – 一次实验可处理96个样本
●高性价比 – 每条lane可以同时测序多达6个样本
●已验证 – 石蜡包埋组织、肿瘤和low-input样本
●完整试剂盒 – 亚硫酸氢盐转化试剂, MspI酶, 包含barcodes的文库制备试剂和spike-in对照
图2 各厂家之间CpG覆盖度的对比
产品名称 |
货号 |
规格 |
Premium RRBS Kit x24 |
C02030032 |
24 rxns |
Premium RRBS Kit x96 |
C02030033 |
96 rxns |
优质 WGBS Kit (Whole Genome Bisulfite Sequencing,全基因组重亚硫酸盐测序)
●全基因组DNA甲基化筛选 – 从全基因组中制备亚硫酸氢盐转化的DNA文库
●兼容ChIP-Bis-Seq – 将ChIP和DNA甲基化结合在一次实验中
●完整试剂盒 – 亚硫酸氢盐转化试剂和文库制备试剂
图3 A: 使用Diagenode的iDeal ChIP-seq Kit对人细胞系Gm12878 H3K27me3标记的组蛋白进行染色质免疫沉淀;B: 使用Premium WGBS Kit对ChIP’d DNA进一步处理并测序。
产品名称 |
货号 |
规格 |
Premium WGBS Kit |
C02030034 |
8 rxns |
Diagenode简介
Diagenode公司2003年成立于比利时,是世界上生产表观遗传学产品的知名公司。表观遗传学及二代、三代测序样本前处理专家,是表观遗传学、生物样本制备和诊断的完整表观遗传学解决方案的领先供应商。该公司提供创新的Biorutpor破碎以及IP-star自动化仪器、试剂盒和高品质抗体,以简化DNA甲基化、ChIP以及ChIP-Seq的工作流程。