“Biu! Biu! Biu!
想要文章高大上,基因测序来帮忙!
文库构建难,难!难?
选对试剂,一切都不是事儿!”
小达君暖心推荐Diagenode低样本量文库构建试剂盒,让小样本量的基因测序也成为可能!下面,我们就来看看这款试剂盒到底有多优秀吧。
The MicroPlex Library PreparationTM Kit v2
▶ 单管操作,只需3步,2小时完成;
▶ Input只需pg级别;
▶ 减少潜在的bias——更少的PCR扩增反应;
▶ 高灵敏度的ChIP-seq——PCR重复率低;
▶ 高通量的灵活性,含有48 barcodes(8 nt);
▶ 可自动化操作
简单快速的操作流程
Fig.1 比较MicroPlex kit和Illumina® TruSeq™ kit构建文库的操作流程
MicroPlex ki只需要一次纯化,三步即可完成。而Illumina®的工作流程需要纯化多次,经过5步才能完成。
只需少量起始样本量—— 50pg DNA
Fig.2 片段化的dsDNA, input范围从50pg至50ng,通过快速简单的3-step protocol,在Illumina®NGS平台制备测序文库。扩增纯化后的文库用于测序。Kit里面的indexing试剂,可在每条测序通道进行12个样本的测序。
从少量起始样本中获得高品质的测序数据
Fig.3 对ChIP-seq富集产物的可靠检测,并与ChIP-seq参考数据完美匹配。
A、用Diagenode的H3K4me3抗体、True MicroChIP Kit进行ChIP实验,10000个细胞中ChIP下来17pg DNA,对照组35pg DNA。IP下来的DNA用MicroPlex Library Preparation Kit扩增并被转化为可用于Illumina®平台测序的文库,通过IlluminaR Genome Analyzer分析文库,根据说明书进行簇生成和测序。
B、观察到前40%的ChIP peaks与参考dataset间完美匹配。基于NIH Encode项目规范,如果前40%的peaks与对比dataset有至少80%的重叠比例,ChIP-seq 的结果被认为是original 和reproduced dataset间有重合性。
品牌简介
Diagenode公司2003年成立于比利时,是世界上生产表观遗传学产品的知名公司。其产品包括声波破碎机(Bioruptor®),自动化系统(IP-Star®),染色质免疫沉淀反应(ChIP)和DNA甲基化分析,高质量的抗体,是表观遗传学、生物样本制备和诊断的完整表观遗传学解决方案的领先供应商。
产品信息
产品货号 |
产品名称 |
规格 |
品牌 |
C05010012 |
MicroPlex Library Preparation kit v2 x12 (12 indices) |
12 rxns |
Diagenode |
C05010013 |
MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (12 indices) |
48 rxns |
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C05010014 |
MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (48 indices) |
48 rxns |
|
C01010131 |
True MicroChIP & MicroPlex Library Preparation Package |
16 ChIP rxns and 12 library prep rxns |